Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh12Q5RJH3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms