Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d4Q5RJF7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms