Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms