Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms