Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms