Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms