Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms