Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms