Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam208bQ5DTT3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Fam208bQ5DTT3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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