Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms