Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms