Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trp53i11Q4QQM4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trp53i11Q4QQM4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trp53i11Q4QQM4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trp53i11Q4QQM4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms