Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms