Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm906Q3V0M1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm906Q3V0M1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm906Q3V0M1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm906Q3V0M1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm906Q3V0M1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm906Q3V0M1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm906Q3V0M1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm906Q3V0M1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm906Q3V0M1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms