Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms