Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed1Q3V009 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms