Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm6Q3UZD5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms