Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim40Q3UWA4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim40Q3UWA4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms