Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
D130052B06RikQ3UW13 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms