Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms