Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx21Q3UR97 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms