Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms