Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Skap2Q3UND0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms