Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms