Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms