Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms