Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UJP5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UJP5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UJP5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UJP5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UJP5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms