Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gtpbp2Q3UJK4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gtpbp2Q3UJK4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gtpbp2Q3UJK4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gtpbp2Q3UJK4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms