Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod2Q3UHZ5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms