Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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