Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms