Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rnf180Q3U827 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rnf180Q3U827 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rnf180Q3U827 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rnf180Q3U827 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rnf180Q3U827 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rnf180Q3U827 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Rnf180Q3U827 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Rnf180Q3U827 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Rnf180Q3U827 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf180Q3U827 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Rnf180Q3U827 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Rnf180Q3U827 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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