Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U7U4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms