Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms