Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud5Q3U2S4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms