Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdnep1Q3TP92 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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