Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Treml4Q3LRV9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Treml4Q3LRV9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Treml4Q3LRV9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Treml4Q3LRV9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Treml4Q3LRV9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Treml4Q3LRV9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Treml4Q3LRV9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Treml4Q3LRV9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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