Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms