Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd11Q1RNF8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms