Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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