Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cers3Q1A3B0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Cers3Q1A3B0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Cers3Q1A3B0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cers3Q1A3B0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms