Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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ptchd1Q14B62 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ptchd1Q14B62 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ptchd1Q14B62 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ptchd1Q14B62 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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