Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rpusd3Q14AI6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rpusd3Q14AI6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd3Q14AI6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms