Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms