Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Traf3ip1Q149C2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Traf3ip1Q149C2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3ip1Q149C2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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