Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli2Q0VGT2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms