Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms