Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col19a1Q0VF58 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col19a1Q0VF58 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms