Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5bQ0V8T8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms