Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neurl1bQ0MW30 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms